自从华西医科大学合并到四川大学之后，川渝两地综合实力最强的医科大学，就是重庆的第三军医大学和重庆医科大学了。据2021年医学界发布的中国医学院综合实力排行榜的名单显示，重庆医科大学以19名的成绩上榜。成都中医药大学则没有出现在前30名的榜单之中。
但奇怪的是，综合实力更弱的成都中医药大学，几年前就成为了双一流大学。实力更强的重庆医科大学，至今没有能够升级成为双一流，这是为何呢？
其中最重要的因素，就是国家目前正在大力扶持和壮大中医药产业，因此在双一流评选的时候，也会向中医药大学进行倾斜。而普通类型的医科大学，业内竞争又过于激烈，重医短期内很难实现突破。
截至目前为止，我国位列“双一流”高校的中医药大学有：北京中医药大学、广州中医药大学、南京中医药大学、上海中医药大学、成都中医药大学以及天津中医药大学等6所学校。这些学校的实力如果与其他医科大学相比，并不太占有优势，但因为赶上了政策的春风，最终得以不断地发展壮大。
就以重庆医科大学和成都中医药大学的对比为例，目前，重庆医科大学无论是博士点、硕士点数量，还是重点实验室数量，都明显处于领先地位。但在国家特色专业数量方面，仍然是零。而成都中医药大学的护理学、中西医临床医学、中医学等8个专业，已经被纳入了国家特色专业。
好在重庆已经意识到了这个问题，在四大直辖市中，北京、上海、天津中医药大学都已经入选双一流高校的前提下。重庆也抓紧时间进行布局。
目前，位于璧山区的重庆中医药学院，一期工程即将完工，今年9月将实现招生。未来，重庆将依托重医的力量，培育壮大中医药学院，并力争早日升级为中医药大学。补齐这方面的短板。
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